截至2019年，南京审计大学金审学院设有7院1部。共计21个本科专业，5种学科门类，4个专业方向。学校面向全国招生，以江苏省招生为主。设置会计与审计学院、国际商学院、金融与经济学院、管理学院、信息科学与工程学院、教师教育学院及艺术设计学院等7个二级学院，设立21个本科专业：审计学、会计学、财务管理、金融学、保险学、国际经济与贸易、税收学、工商管理、物流管理、行政管理、资产评估、酒店管理、工程管理、计算机科学与技术、网络工程、信息管理与信息系统、汽车服务工程、学前教育（师范类）、环境设计（艺术类）、视觉传达设计（艺术类）。国际商学院设有审计学（中澳“3+1”项目、管理会计CIMA方向班）、会计学（管理会计CIMA方向班）等专业方向。